г. Пущино, ул.Институтская, д.7, Институт биологического приборостроения с опытным производством РАН
ibp@ibp-ran.ru+7 (977) 193-77-41
English
IBP logo
Поле заполнено неправильно
Институт Биологического Приборостроения РАН
0Корзина

Лаборатория новых методов в биологии (№ 22)

Заведующий лабораторией кандидат физико-математических наук Сергей Евгеньевич Пермяков

+7 (977) 193-77-41

Направления деятельности

Группа исследования белков (руководитель - к.ф.м.н. С.Е. Пермяков)​

  • Исследование физико-химических и функциональных свойств
    металл-связывающих белков: α-лактальбумин, лизоцим, парвальбумин,
    кальмодулин, рековерин, S-100 и т.д. Металлопротеомика. Исследование
    роли катионов металлов в функционировании белков.
  • Исследование механизмов функционирования металл-связывающих белков в клетке.
  • Исследование нативно неупорядоченных белков. Белок-белковые взаимодействия.
  • Разработка методов конструирования белковых структур с заданными свойствами.
  • Разработка молекулярных основ новых методов диагностики и лечения онкологических заболеваний.
  • Поиск и разработка новых перспективных экспериментальных методов для физико-химической биологии.

Картографическая группа (руководитель - В.И. Степанова)​

  • Разработка новых методов обработки карт различных поверхностей, а
    также сбор, обработка, систематизация, размножение и хранение
    графических, фотографических и картографических материалов.
Технические разработки​
​Основные публикации
​Некоторые публикации лаборатории по тематике нативно разупорядоченных белков​
Состав лаборатории
  • Пермяков Сергей Евгеньевич, к.ф.-м.н., зав. лаб. Новых методов в биологии
  • Пермяков Евгений Анатольевич, д.б.н., проф., г.н.с.
  • Денесюк Александр Ильич, д.ф.-м.н., г.н.с.
  • Грищенко Валерий Мефодьевич, к.б.н., с.н.с.
  • Емельяненко Виктор Иванович, к.ф.-м.н., c.н.с.
  • Казаков Алексей Сергеевич, к.б.н., с.н.с.
  • Авхачева Надежда Владимировна, к.б.н., с.н.с.
  • Литус Екатерина Андреевна, к.м.н., с.н.с.
  • Дерюшева Евгения Игоревна, к.ф.-м.н., с.н.с.
  • Шевелева Марина Петровна, к.х.н., ст.н.с.
  • Немашкалова Екатерина Леонидовна, к.б.н., с.н.с.
  • Вологжанникова Алиса Андреевна, к.б.н., с.н.с.
  • Соколов Андрей Сергеевич, к.б.н., с.н.с.
  • Лаптева Юлия Сергеевна, к.б.н., с.н.с.
  • Пермякова Мария Евгеньевна, н.с.
  • Назипова Алия Анцаровна, н.с.
  • Ломоносова Анна Викторовна, н.с.
  • Растрыгина Виктория Александровна, н.с.
  • Улитин Андрей Борисович, н.с.
  • Боброва Лолита Алексеевна, м.н.с.
  • Степанова Вера Игоревна, н.с., руководитель Группы картографии
  • Баранов Игорь Павлович, инж.
  • Клам Екатерина Евгеньевна, вед. констр.
  • Платонова Татьяна Марьяновна, лаб.
Основные приборы и оборудование лаборатории
  • Спектрополяриметр J-810, Jasco.
  • Спектрофлуориметр Cary Eclipse, Varian, с приставкой stopped flow, Applied photophysics.
  • Спектрофотометр Cary 100, Varian.
  • Инфракрасный спектрометр с Фурье-преобразованием Nicolet-6700, Thermo Scientific.
  • Хроматограф высокого давления Shimadzu
  • Центрифуги Backman Coulter Avanti J-26XP; Hitachi Himac CP80WX; Eppendorf 5804R.
  • Многоцветная система регистрации ПЦР в реальном времени IQ5 (BioRad).
  • Гель-сканер Pharos FX Plus (BioRad).
  • Система для измерения плазмонного резонанса ProteOn XPR (BioRad).
  • Система для измерения плазмонного резонанса.
  • Сканирующий калориметр Nano-DSC (AT Instruments).
  • Изотермический титрационный калориметр Nano-ITC (AT Instruments).
  • Оптический микроскоп (Kyence Biozero).
  • Инкубатор CO2 (ИБП РАН).
  • Дезинтегратор клеток (French press) (ИБП РАН).
  • Дзета-сайзер Nano ZS (Malvern)
  • Вискозиметр SV-10 (A&D Company)
  • Генератор льда
  • Стерилизатор
  • Высокоскоростной сортировщик клеток MoFlo XDP, Beckman Coulter, USA
Гранты​
  • Грант SABIT (США) - 1993
  • Грант CAST (США) - 1993
  • Грант Сороса - 1994-1995
  • Грант НАТО - 1994-1996
  • Грант РФФИ - 1998
  • Грант НАТО - 1999
  • Грант РФФИ - 2001
  • Грант INTAS - 2002
  • Грант INTAS - 2004
  • Грант РФФИ-Московской области - 2004
  • Грант Программы Президиума РАН «Фундаментальные науки - медицине» - 2004
  • Грант Программы Президиума РАН «Молекулярная и клеточная биология» - 2004-2008
  • Грант CRDF - 2005
  • Грант Фонда содействия отечественной науке - 2006
  • Грант Федерального агенства по науке и инновациям - 2006
  • Грант Программы Президиума РАН «Фундаментальные науки - медицине» - 2007
  • Грант Президента РФ - 2007-2008
  • Грант Программы Президиума РАН «Молекулярная и клеточная биология» - 2009-2013
  • Грант Программы Президиума РАН «Фундаментальные науки - медицине» - 2012
  • Грант РФФИ - 2012
  • Грант Программы Президиума РАН «Фундаментальные науки - медицине» - 2013-2014
  • Грант РФФИ - 2014
  • Грант Программы Президиума РАН «Молекулярная и клеточная биология» - 2014
  • Грант РФФИ-Московская область - 2014
  • Лот НТП по приоритетному направлению «Науки о жизни» Министерства образования и науки - 2014
  • Грант Российского научного фонда 2016-2018 гг.
  • Грант Российского научного фонда - 2019-2021 гг.
  • Грант РФФИ - 2019-2021 гг
  • Грант Российского научного фонда - 2020-2023 гг.
Индекс цитирования руководителя и сотрудников лаборатории

Количество ссылок без самоцитирования и индекс Хирша за годы, начиная с 1975, согласно базе данных Google scholar:​

Монографии​
  • Пермяков Е.А. Парвальбумин и родственные кальций-связывающие белки. Москва, "Наука", 1985, 191 с.
  • Пермяков Е.А. Кальцийсвязывающие белки. Москва, Наука, 1993, 190 с.
  • Permyakov, E.A. Luminescent Spectroscopy of Proteins. CRC Press, Boca Raton, Ann Arbor, London, Tokyo, 1993, 164 p.
  • Пермяков Е.А. Метод собственной люминесценции белка. Москва, "Наука", 2003, 189 с.
  • Степанов И.Н. Теория пластики рельефа и новые тематические карты. Москва, Наука, 2006, 229 с.
  • Permyakov, E.A. a-Lactalbumin. Nova Science Publishers, New York, 2005, 136 p.
  • Permyakov, E.A. Parvalbumin. Nova Science Publishers, New York, 2006, 196 p.
  • Permyakov, E.A. Metalloproteomics. A John Wiley & Sons, Inc., Hoboken, New Jersey, 2009, 786 p.
  • Permyakov, E.A., and Kretsinger, R.H. Calcium Binding Proteins. A John Wiley & Sons, Inc., Hoboken, New Jersey, 2011, 573 p.
  • Пермяков Е.А. Металлсвязывающие белки: структура, свойства, функции. Научный мир, Москва, 2012, 544 с.
  • Morozova, L.A., Berliner, L.J. and Permyakov, E.A. Calcium Binding Lysozymes. Nova Science Publishers, New York, 2012.
Сборники статей под редакцией В.Н. Уверского и Е.А. Пермякова​
  • Methods in Protein Structure and Stability Analysis. Part A.
    Luminescence Spectroscopy and Circular Dichroism. Nova Biomedical Books,
    New York, 2007, V.N. Uversky & E.A. Permyakov, eds.
  • Methods in Protein Structure and Stability Analysis. Part B.
    Vibrational Spectroscopy. Nova Biomedical Books, New York, 2007, V.N.
    Uversky & E.A. Permyakov, eds.
  • Methods in Protein Structure and Stability Analysis. Part С.
    Conformational Stability, Size, Shape and Surface of Protein Molecules.
    Nova Biomedical Books, New York, 2007, V.N. Uversky & E.A.
    Permyakov, eds.
  • Methods in Protein Structure and Stability Analysis. Part С. NMR
    and EPR Spectroscopies, Mass-Spectrometry and Protein Imaging. Nova
    Biomedical Books, New York, 2008, V.N. Uversky & E.A. Permyakov,
    eds.
  • Kaleidoscope of Structural Properties and Functions, Research Singpost, Kerala, India, 2003, Ed. V.N. Uversky.
  • The Wiley Series in Protein and Peptide Science (Uversky V.N.
    series Ed.), John Wiley & Sons, Inc, Hoboken, New Jersey, USA. ISBN:
    978-0-470-59169-7 (2012)
  • Methods and Experimental Tools (Editors: Uversky V.N., Dunker
    A.K.), Humana Press, Totowa, NJ, USA. ISBN: 978-161-77-9926-6 (2012)
  • Kretsinger R.H., Uversky V.N., Permyakov E.A. (eds) Encyclopedia
    of Metalloproteins. Springer, 2013, 2574 p. 1108 illus., 777 illus. in
    color. In 4 volumes.
Авторские свидетельства и патенты​
  • Орешкин Е.Ф., Борисова М.А., Чубарова Г.С., Пермяков Е.А.,
    Бурштейн Э.А. Способ определения максимально допустимой температуры
    нагрева мясного сырья высшего сорта. Авторское свидетельство N 1411666,
    1988.
  • Пермяков Е.А., Шныров В.Л., Дятчин И.В., Бурштейн Э.А. Способ
    определения концентрации кальция в растворе. Авторское свидетельство N
    1580256, 1990.
  • Ларин В.Т., Пермяков Е.А., Фрейдин А.А. Способ проведения
    групповых анализов биохимических образцов в жидкой форме. Патент на
    изобретение N2142638, 1999.
  • Редикюльцев Ю.В., Ширшиков Н.В., Кудряшов В.К., Пермяков Е.А.
    Способ каскадно-проточного культивирования микроорганизмов. Патент на
    изобретение N2193594, 2002.
  • WO 2015174978 A1 by Ilya Alexandrov, Khikmet Sadykov, Roman
    Mikhailov, Dina Abramovich, Sergei Permyakov, Tajib Mirzabekov, Alexey
    Repik, Vasily Ignatiev, Mikhail Samsonov, Yan Lavrovsky: “Antibodies
    against human receptor integrin alpha-4”; priority 2014/05/15
  • Михайлов Р.В., Мирзабеков Т.А., Соловьев В.В., Яковенко А.Р., Растрыгина В.А., Пермяков С.Е., Казаков А.С., Соколов А.С., Пермяков Е.А. Патент RU2019130673A: “Терапевтическое антитело, специфичное к интерлейкину-11, ингибирующее сигналирование через его рецептор, и способ его использования для лечения пациентов”, 2021.Защиты диссертаций

В лаборатории защитили диссертации:​

  • Дейкус Г.Ю., 1996 г., к.ф.м.н.
  • Вепринцев Д.Б., 1998 г., к.б.н.
  • Уверский В.Н., 1998 г., д.ф.-м.н.
  • Пермяков С.Е., 2001 г., к.ф.-м.н. - автореферат диссертации
  • Морозова-Рош Л.А., 2002 г., д.ф.-м.н.
  • Жадан А.П., 2003 г., к.б.н. - автореферат диссертации
  • Бакунц А.Г., 2009 г., к.б.н. - автореферат диссертации
  • Казанцев А.П., 2009 г., к.т.н.
  • Князева (Немашкалова) Е.Л., 2010 г., к.б.н. - автореферат диссертации
  • Сенин А.А., 2012 г., к.т.н.
  • Лаптева Ю.С., 2012 г., к.б.н.
  • Ломоносова А.В., 2017 г., к.б.н.
  • Соколов А.С., 2018 г., к.б.н.
  • Вологжанникова А.А., 2020 г., к.б.н.
  • Хорн П.А., 2021 г., к.б.н.
Сотрудничество

Лаборатория сотрудничает со следующими научными организациями:​